Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SOBPA7XYQ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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