Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GOLGA6CA6NDK9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6CA6NDK9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms