Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CEACAM5-210ENST00000617332 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF39Q9H2S5 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms