Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ODF1Q14990 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms