Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SCARF1Q14162 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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