Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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PTPRSQ13332 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRSQ13332 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRSQ13332 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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