Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TRIM28Q13263 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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