Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SRSF6Q13247 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms