Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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NME3Q13232 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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NME3Q13232 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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NME3Q13232 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NME3Q13232 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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