Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHAF1AQ13111 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHAF1AQ13111 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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