Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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FOXC1Q12948 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXC1Q12948 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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