Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPREP23469 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPREP23469 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPREP23469 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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