Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP17L18D6R9N7 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms