Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4Q9P0V3 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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