Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ3-201ENST00000295101 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-210ENST00000535648 7508 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NPHS1-201ENST00000353632 3741 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR9-202ENST00000357632 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FHAD1-202ENST00000358897 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP7-203ENST00000375732 5063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP2-202ENST00000443831 4007 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445471.2-201ENST00000568143 2443 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CHEK1-213ENST00000532449 4051 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD7-207ENST00000639879 5098 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CD163L1-201ENST00000313599 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM234B-201ENST00000197268 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf15-201ENST00000305199 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL136087.1-201ENST00000305491 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX4-203ENST00000378740 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TARM1-201ENST00000432826 897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073046.1-201ENST00000441217 390 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092042.3-203ENST00000443313 950 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL683842.1-201ENST00000455505 525 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL666P-201ENST00000460953 304 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL334P-201ENST00000465067 279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV1-37-201ENST00000465170 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL302P-201ENST00000475999 300 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL845P-201ENST00000484385 290 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106872.7-201ENST00000508621 312 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001767.1-201ENST00000530976 286 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms