Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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