Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MSMPQ1L6U9 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MSMPQ1L6U9 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms