Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms