Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FAM187BQ17R55 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FAM187BQ17R55 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FAM187BQ17R55 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FAM187BQ17R55 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FAM187BQ17R55 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms