Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms