Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TTF1Q15361 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms