Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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NCAPHQ15003 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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