Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
VGLL4Q14135 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms