Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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