Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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