Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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