Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN3Q13064 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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