Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245452.3-201ENST00000413294 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TPI1P1-201ENST00000420977 750 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL929410.1-201ENST00000428250 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM231A-201ENST00000434336 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1IP1-AS1-201ENST00000436893 376 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL358790.1-203ENST00000440461 579 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590396.1-201ENST00000450208 775 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL310P-201ENST00000465317 281 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL625P-201ENST00000488637 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004858.1-201ENST00000554078 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DUOXA1-215ENST00000560572 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 Z84723.1-201ENST00000568710 773 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005058.1-201ENST00000580193 2975 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF559-206ENST00000587557 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02255-201ENST00000619758 199 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM231C-201ENST00000624031 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2B11-203ENST00000641527 4545 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF43-202ENST00000357491 5249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007608.3-201ENST00000570167 5214 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-203ENST00000394872 6750 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF614-201ENST00000270649 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB4-201ENST00000519479 4578 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP41-217ENST00000541543 6222 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TG-208ENST00000519543 3132 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-201ENST00000261458 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1F-222ENST00000613525 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GDA-202ENST00000358399 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK6-213ENST00000560346 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms