Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LAPTM4AQ15012 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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