Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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COL19A1Q14993 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL19A1Q14993 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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