Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SMC1AQ14683 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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