Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SCARB2Q14108 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SCARB2Q14108 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SCARB2Q14108 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SCARB2Q14108 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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