Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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NCOA4Q13772 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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NCOA4Q13772 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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NCOA4Q13772 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NCOA4Q13772 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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