Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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