Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1BP53609 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP53609 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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