Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C9orf135Q5VTT2 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms