Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNAPC1Q16533 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNAPC1Q16533 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNAPC1Q16533 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNAPC1Q16533 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNAPC1Q16533 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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