Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SCN9AQ15858 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SCN9AQ15858 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SCN9AQ15858 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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