Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIXQ14938 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms