Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NEDD9Q14511 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms