Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
NEUROD1Q13562 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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