Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NFIAQ12857 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms