Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1Q9UJ41 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1Q9UJ41 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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RABGEF1Q9UJ41 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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RABGEF1Q9UJ41 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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