Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HERC3Q15034 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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