Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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