Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHPRHQ149N8 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHPRHQ149N8 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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