Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CBFBQ13951 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CBFBQ13951 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms