| RUNX3 | Q13761 | MIR1322-201 | ENST00000638013 | 71 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MKKS-204 | ENST00000639674 | 192 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-206 | ENST00000413890 | 4473 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000776.1-201 | ENST00000530032 | 1663 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CENPJ-205 | ENST00000545981 | 4299 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTBP2-211 | ENST00000609116 | 12014 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK6PS3-201 | ENST00000403865 | 2162 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LPAR6-209 | ENST00000620633 | 2175 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA0586-209 | ENST00000556134 | 5912 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATXN3-248 | ENST00000558190 | 26812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CREM-206 | ENST00000354759 | 1589 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOBP-204 | ENST00000618129 | 1550 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104454.1-201 | ENST00000421341 | 1401 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF404-201 | ENST00000324394 | 1844 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-492P-201 | ENST00000363035 | 104 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU5D-1-201 | ENST00000363299 | 116 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.169-201 | ENST00000363745 | 96 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-921P-201 | ENST00000384361 | 107 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-757P-201 | ENST00000410334 | 100 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP220-201 | ENST00000410611 | 288 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP35P2-201 | ENST00000416748 | 943 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121872.1-201 | ENST00000420327 | 281 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC116035.1-201 | ENST00000431057 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZMYM4-AS1-201 | ENST00000432683 | 459 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC241584.1-201 | ENST00000438469 | 1241 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL008629.1-201 | ENST00000438615 | 184 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00363-201 | ENST00000443228 | 210 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P56-201 | ENST00000444468 | 240 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ART2BP-201 | ENST00000453501 | 499 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | ITCH-AS1-201 | ENST00000454205 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN2P7-201 | ENST00000456186 | 273 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH9-AS4-201 | ENST00000456459 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112229.2-201 | ENST00000456683 | 476 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP62-201 | ENST00000463396 | 453 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MDM2-217 | ENST00000478070 | 692 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010486.2-201 | ENST00000505572 | 483 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112178.1-201 | ENST00000511165 | 676 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116353.3-201 | ENST00000511215 | 249 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1129P-201 | ENST00000515964 | 104 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA48.10-201 | ENST00000516965 | 160 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108515.1-201 | ENST00000517407 | 525 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022790.1-201 | ENST00000522872 | 204 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL2BPP5-201 | ENST00000523141 | 481 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003730.2-201 | ENST00000526385 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356215.1-201 | ENST00000528366 | 1102 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000857.2-201 | ENST00000532123 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAP1B-224 | ENST00000541216 | 701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009803.2-201 | ENST00000550378 | 665 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HIGD1AP17-201 | ENST00000554576 | 276 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02311-201 | ENST00000556144 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DUXAP1-201 | ENST00000556632 | 463 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025682.1-201 | ENST00000582389 | 437 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC067852.4-201 | ENST00000590314 | 478 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099811.4-201 | ENST00000592536 | 496 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006557.3-201 | ENST00000592926 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | DUXAP3-201 | ENST00000603616 | 594 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451074.6-201 | ENST00000608512 | 729 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC131235.4-201 | ENST00000609288 | 620 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092142.2-201 | ENST00000614642 | 354 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098679.5-201 | ENST00000624394 | 571 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139220.2-223 | ENST00000625982 | 921 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLITRK5-201 | ENST00000325089 | 21103 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TIGD2-201 | ENST00000317005 | 2083 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAGE4P-201 | ENST00000442271 | 3381 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERBIN-214 | ENST00000511297 | 4257 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC000403.1-201 | ENST00000613696 | 3585 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ERBIN-204 | ENST00000380943 | 6410 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LBR-202 | ENST00000338179 | 3812 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETDB2-202 | ENST00000317257 | 5619 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND5P28-201 | ENST00000438005 | 1594 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117529.2-201 | ENST00000512159 | 2068 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LATS1-201 | ENST00000253339 | 4256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL079305.1-201 | ENST00000623159 | 3008 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRF1-202 | ENST00000354855 | 838 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR423-201 | ENST00000362201 | 94 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA5B-201 | ENST00000363786 | 132 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR1A2-201 | ENST00000381951 | 930 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA54-201 | ENST00000384281 | 123 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-441P-201 | ENST00000384545 | 106 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP47-201 | ENST00000408017 | 460 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-42P-201 | ENST00000410697 | 113 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAP1BP1-201 | ENST00000412709 | 553 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS3AP9-201 | ENST00000417027 | 792 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01065-201 | ENST00000417989 | 577 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL078581.1-201 | ENST00000419134 | 340 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBDY-202 | ENST00000423617 | 543 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TXNDC8-204 | ENST00000423740 | 356 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002075.2-201 | ENST00000425207 | 252 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008065.1-201 | ENST00000428525 | 348 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP5F1P1-201 | ENST00000433775 | 569 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP5-201 | ENST00000437270 | 562 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012070.1-201 | ENST00000442062 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01683-201 | ENST00000443479 | 412 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |