Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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