Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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CLN3Q13286 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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