Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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SEMA3BQ13214 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SEMA3BQ13214 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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SEMA3BQ13214 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SEMA3BQ13214 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SEMA3BQ13214 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SEMA3BQ13214 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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